底泥环境中存在的大量微生物对于动物健康和水产养殖微生态系统有重要贡献，但其群落多样性和群落装配机制尚未明了。

我实验室海洋生命过程与生物资源利用创新团队采用16S rRNA扩增子测序和随机确定性分析等方法，在中尺度上探究了凡纳滨对虾养殖池塘底泥环境中的细菌群落多样性及其装配机制，研究发现：1.底泥中细菌群落多样性丰富，34个核心操作分类单元（operational taxonomic units，OTUs）与底泥理化特性显著相关；2. Proteobacteria、Bacteroidetes、Chloroflexi、Cyanobacteria、Acidobacteria、Firmicutes、Actinobacteria、Ignavibacteriae、Spirochaetae和Planctomycetes是前10个相对丰度较高的门。值得注意的是，一些条件致病菌（如Vibrio和Photobacterium）和潜在功能微生物（如Nitrospira、Nitrosomonas、Desulfobulbus和Desulfuromusa）在池塘底泥环境中广泛分布。更重要的是，在中尺度上，对虾养殖池塘底泥环境中细菌群落相似性随距离的增加而显著递减，且其空间演替受随机性过程所控制。此外，pH、总氮含量等确定性因素对底泥中细菌群落结构也有重要影响。该研究结果提高了我们对水生生态系统微生态的认识，有助于水产养殖中底泥环境微生物群落的管理。

养殖池塘底泥环境细菌群落的多样性及装配机制示意图

研究成果于2021年6月在Applied Microbiology and Biotechnology（中科院2区Top期刊）上发表，题目为：“Stochastic processes shape the bacterial community assembly in shrimp cultural pond sediments”。创新团队首席何建国教授和骨干成员黄志坚副教授为该论文的共同通讯作者，中山大学海洋科学学院博士后侯冬伟为该文章的第一作者。

该研究得到了国家自然科学基金、国家虾蟹产业技术体系、广东省重点领域科技项目、广东省自然科学基金、南方海洋实验室创新团队建设科研经费的支持。

原文链接：https://doi.org/10.1007/s00253-021-11378-9