1994,12-1995,05 中国科学院南海海洋研究所沉积室，副研究员，研究室副主任，代主任
1995,05-1998,06 德国汉堡大学生物地球化学与海洋化学研究所，助理研究员
1998,08-2000,08 日本科技厅特别研究员STA fellow（JAMSTEC）
2000,09- 2014,09 中国科学院海洋研究所研究员、博士生导师，海洋地质与环境重点实验室副主任、主任
2004,06-2004,10 德国汉堡大学地球物理研究所（马普学会合作研究）
2005,09-10 日本东京大学JSPS Fellowship
2006,09-10 日本东京大学JSPS Fellowship
2007,12-2008,01 日本东京大学JSPS Fellowship
2009,10-12 美国Scripps海洋研究所访问研究
2005,10-2009,09 中国石油大学（华东）特聘教授、山东省“泰山学者”
2010,01- 2014,12 中国科学院海洋研究所油气研究中心主任
2010,12-2011,01 加拿大地质调查局Pacific Geoscience Center和维多利亚大学访问学者
2012,11-2012,12 美国University of Texas at Austin访问学者
2014,09-至今 中国科学院深海科学与工程研究所，研究员、博士生导师，深海地球物理与资源研究室主任
2016,12-至今 海南省海底资源与探测技术重点实验室主任

1. NSFC-广东省联合基金重点项目“南沙海区减薄陆壳裂陷盆地构造演化及特色深水油气系统”，2018.01-2021.12. 272万元，在研，主持；
2. 国家科技部“973”项目，深水钻井浅层地质灾害形成机理及预测方法，2016.7.1-2020.6.30， 269万元，在研，主持；
3. 科学院先导A课题“海山形态结构与沉积记录”，2013-2017年，4000万元，已结题，主持；
4. 国家基金委重点项目“ 南海北部深水盆地油气渗漏系统与天然气水合物富集机制研究”，2010.1-2013.12， 174万元，已结题，主持；
5. 自然科学基金项目“雅浦海沟洋脊俯冲的构造作用研究”，2016.1.1-2019.4.20，100万元，已结题，主持；
6. 自然科学基金“ 南海北部淹没碳酸盐台地发育演化及混合沉积研究”，2013.1-2016.12， 240万元，在研，主持；
7. 中科院重点项目“深渊浅层构造特征及其与深渊底部流体活动的关系”，2014.1.1-2016.3.1, 220万元，已结题，主持；
8. 中科院知识创新前沿项目“海南新生代碳酸盐台地发育演化及其深水油气意义”，2014.10.1 -2017. 9.30 ，200万元， 已结题，主持；
9. 中国科学院重要方向性项目 “大陆坡天然气水合物形成的地质条件与成藏机理研究”，2003-2006年，280万元，已结题，主持；
10. 国家118专项“我国大陆坡天然气水合物的地质构造条件研究”，2003-2010年，300万元，已结题，主持；

吴时国、张健，2017. 海洋地球物理探测. 科学出版社，350pp
吴时国、张健，2014. 海底构造与海洋地球物理学. 科学出版社，310pp
吴时国、孙运宝，2019. 南海深水地质灾害. 科学出版社.
吴时国、喻普之，2006 海底构造学导论. 北京: 科学出版社，pp306
吴时国、姚伯初，2009 天然气水合物形成的地质构造分析与资源评价. 北京: 科学出版社，pp306
吴时国、王秀娟、王志君、陈端新、孙启良著，2015. 天然气水合物地质概论. 科学出版社.
吴时国、王大伟、孙启良、姚根顺 著，2015 南海深水沉积与储层的地震识别. 科学出版社
罗又郎、涂霞、吴时国、郑范， 1995. 南沙海域晚第四纪古海洋学. 科学出版社.
孙永壮、吴时国，2008 . 渤海湾盆地桩海地区古潜山构造分析与裂缝预测. 武汉: 中国地质大学出版社，pp256.
刘元生、吴时国 主编. 2008 中国地球物理年刊. 中国海洋大学出版社.
刘元生、吴时国 主编. 2010, 山东地球物理60年。 中国海洋大学出版社.